Beton depolarda izolason ve seramik kaplama oldukça kaliteli malzeme ve iyi işçilik gerektirmektedir. İçme ve Kullanma suyu kriterlerine uygun hijyen raporu olan izolasyon malzemeler kullanılmalıdır. Seramik kaplama yapılmadan önce kesinlikle izolasyon yapılmalıdır. Su deposunda kullanılacak olan ve suyla temas eden her türlü malzeme içme ve kullanma suyuna uygun olmalıdır. Beton seramik depoların fiziki temizlik, biyolojik dezenfekte işlemleri ile periyodik bakımları ihmal edilmemelidir. Su kesintilerinin olduğu dönemlerde temizlik işlemleri daha sık yaptırılmalıdır. Su deposunun temizliği Sağlık Bakanlığından yetkili biyosidal ürün uygulama yetkisine sahip firmalara yaptırılmalıdır.

İzlasyonu yapılmamış betonarme yer altı su depolarında yaşanan en önemli konu içerisinde bulunan suyu dışarı sızdırması veya negatif basınç sonucu yeraltı sularının çatlaklardan içeri sızarak biyolojik olarak suyu kirletme riskidir. Betonarme su depolarında en çok düşülen hata ise izlasyon yapılmadan sadece fayans veya kalebodur gibi seramik kaplamalar ile suyun korunabileceğini, su sızmalarının engellenebileceğini düşünmektir. Kalebodur ve fayans kaplamalar veya derz dolguları izolasyon değildir. Seramik kaplama su kaçağını engellemeye yetmez. Deponun ömrü ve son kat uygulamalar için izolason mutlaka yaptırılmalıdır.

Paslanmaz çelik, krom nikel, galveniz sac, kullanılarak yapılan metal depolar modüler demonte ve sabit kaynaklı olarak imal edilmektedir. Özellikle paslanmaz malzemeden yapılan depolar gıda endüstrisinde ağırlıklı olarak tercih edilmektedir. İçme kullanma suyuna uygun olduğundan arıtma işlemlerinin devamında depolama amaçlı da kullanılmaktadır. Modüler depolar kurulum kolaylığından ilk tercihlerde yer almaktadır. Kaliteli paslanmazlardan imal edilmiş modüler depolar profesyoneller tarafından monte edilmelidir. Galveniz depolar ise genel olarak kullanma suyu deposu amaçlı kullanılmaktadır. Metal depolarda kesinlikle havalandırma bacası olmalı ve ihtiyaca cevap verecek şekilde ve ölçülerde tasarlanmalıdır.Metal depolar dezenfektan olarak kullanılan klora maruz kaldığında paslanmaktadır. Şebeke suyunda bulunan klorun da etkisiyle, özellikle tavan ve bağlantı bölümleri başta olmak üzere metal depolar şiddetli paslanma ve korozyona uğramaktadır. Paslanma ve korozyon neticesinde depo suyuna karışan demir iyonları insan sağlığı için ciddi tehditler oluşturmaktadır. Metal depolarda kesinlikle içme suyuna uygun klora mukavemeti daha yüksek kalite paslanmaz metal kullanılmalıdır. Tüm depo çeşitleri için geçerli olmak şartıyla en önemli konu, deponun türü yapısı ne olursa olsun, kesinlikle düzenli aralıklarda fiziki temizliği, bakımı yetkili firmalara yaptırılmalı ve mikrobiyolojik dezenfekte işlemlerine tabi tutulmalıdır.